Способствуют распространению возбудителей многих инфекционных заболеваний: дизентерии, брюшного тифа, полиомиелита и др.; они переносят также яйца глистов. Комнатная муха может размножаться круглый год (в теплых помещениях); плодовитость её очень велика.

Главным условием борьбы с мухами является чистота в доме, во дворе и в местах общего пользования. Чтобы предотвратить возможность выплода мух в жилище, надо пищевые продукты держать закрытыми, кухонные отбросы собирать в вёдра с крышками, ежедневно их опорожнять и мыть, мусор во дворах собирать в железные бачки или плотно сколоченные ящики с хорошо прикрывающимися крышками.

При наличии скота или птицы нужно следить за чистотой их помещений: навоз следует своевременно вывозить, пищевые отбросы держать в закрытой посуде.

Для уничтожения личинок и куколок мух под мусорными ящиками и возле них производят обработку почвы 1 раз в 10 дней карболовой кислотой (из расчета 1,5 л на 1 м²) или 3-процентным водным раствором хлорофоса. Для истребления личинок в выгребных уборных и помойных ямах рекомендуется засыпать их поверхность сухой хлорной известью (1 кг на 1 м²) или 3-процентным водным раствором хлорофоса.

Для борьбы с летающими мухами можно пользоваться хлорофосными таблетками и порошками. Таблетку весом до 1 г следует положить в тарелочку и залить 1 ст. ложкой воды (можно добавить немного сахарного песка). По мере испарения воду доливать. Срок действия таблетки 10 – 12 дней. Для уничтожения мух применяется также липкая бумага в виде лент Мухолов, а также липкая масса Мухолов и Муксид, выпускаемая в алюминиевых тубах и стеклянных баночках. Содержимое упаковки надо выдавить на лист бумаги или нанести шпателем и распределить тонким слоем. Листы с массой разложить в местах наибольшего скопления мух. Для борьбы с мухами выпускают также аэрозольные препараты Нефрафос, Дихлофос и дусты Неопин, Неопинат, Фосфолан, Хлорак и Хлорофос — плав и порошок. Для уничтожения мух и ос в жилых, служебных и других помещениях используют полимерную ловушку Инсекта М с приманкой.

Для защиты помещений от мух на окна можно прибить мелкую металлическую сетку или марлю, а на форточки — защитные занавески из бумаги, разрезанной на полоски.